Il n'y a pas vraiment de règle, c'est un peu ton oreille qui décidera.
Ceci dit, on retrouve souvent 2, 3 schémas qui se répètent :
J'aurais tendance à mettre la wha et l'auto-wha avant le compresseur car ce sont des filtres qui réagissent à l'attaque, le compresseur, l'octaver et enfin le flanger (en général il est bon de mettre les effets de "couleur" [Chorus, flanger, phaser...] en fin de chaîne... hormis quand tu as un delay ou une reverb, là, c'est pareil, c'est le rendu que tu veux qui te fera placer ces deux effets... ça dépend aussi si tu utilises des boucles... mais là tout est en série donc...).
Tu peux aussi essayer de mettre le comp en fin de chaîne.
Le mieux c'est donc de tester jusqu'à trouver le meilleur compromis.